箱式中效過濾器在光學儀器中有以下幾個主要應用：

光學鏡頭保護：箱式中效過濾器可以用于保護光學鏡頭，防止灰塵、顆粒物和其他污染物進入鏡頭內部，降低鏡頭的清潔頻率，延長使用壽命。

光學系統的凈化：箱式中效過濾器可以用于凈化光學系統的環境，去除空氣中的微塵、細菌和其他有害物質，提供干凈的工作環境，保證光學系統的穩定性和精度。

環境光控制：箱式中效過濾器可以用于控制光學儀器工作環境中的環境光，例如在顯微鏡、光刻機等需要較低環境光的應用中，通過選擇適當的過濾器材質和設計，可以有效地降低環境光的強度，保證觀察或加工的準確性和穩定性。

激光器的凈化和保護：對于激光器等高精度光學設備，箱式中效過濾器可以用于凈化激光器內部的環境，去除塵埃和顆粒物，保護激光器的工作穩定性和壽命。

需要根據具體的光學儀器和應用需求選擇適當的箱式中效過濾器型號和規格，并遵循制造商提供的安裝和使用說明。